错颌畸形的病因除遗传因素之外，还有环境因素。环境因素可分为先天因素和后天因素。它们之间相互联系，不能截然分开。而且，环境因素和颌面部的功能是密切相关的。
错颌畸形的先天因素
先天因素是指从受孕后到出生前，胎儿在生长发育中，因各种原因所产生的。应该看到，先天因素虽然不一定县有遗传性，但遗传因素却都是先天性的。
1. 母体因素，母亲妊娠时的状态，很大程度上决定了胎儿的发育。妊娠期母体的营养不良、缺少胎儿生长发育必须的钙、磷、铁等矿物质以及维生素 B、CD等，都可造成胎儿发育不良或发育异常。妊娠初期患病，如风疹、中毒、内分泌功能失调、梅毒及其他传染病也会影响胎儿骨的钙化程度，骨缝的闭合时间，牙齿的萌出、乳牙根的吸收，甚至会导致牙齿发育不全。先天性梅毒引起的牙体畸形主要表现在第一恒磨牙、切牙及尖牙牙冠的形态发育异常，如 Hutchinson 切牙及桑棋状磨牙。还可产生颌骨畸形，如上颌骨发育不足，小下颌，使前牙呈反颌或开颌。妊娠期间，母亲受外伤，受镭及大剂量放射线照射，也可引起胎儿的发育畸形。
2.胎儿因素，正常状态下，胎儿在子官内也承受着一定压力，因子宫大小及胎儿体位的变化，这种压力常成为异常的压力或变为外力，压迫胎儿某一部位。特别是子宫狭窄，羊水少对胎儿的影响更为明显，如羊水压力失常、羊膜病变、膝或腿压迫一侧面部、脐带缠绕等都可引起胎儿畸形。胎儿本身内分泌及新陈代谢失调，孕期或分娩时损伤，也可能使胎儿发生畸形，表现为下颌前突、后缩或狭窄等。
3.常见的发育障碍及缺陷，除了胚胎时期已经决定了的遗传影响外，在胎儿的生长发育中，腭突、上颌突及下颌突等各种突起的融合，多数应在胎儿早期完成，形成牙胚及上下颌骨的骨化中心等。如果此时发育障碍，引起的错颌畸形和遗传因素所产生的等同，若有遗传因素参与，出生后则很难鉴别其实质性原因。
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