常规的正畸诊疗资料收集完毕后，储存在诊室的临床资料服务器中，正畸医生在各自的计算机终端对这些资料进行诊断设计后，将治疗计划通过因特网传输至矫治器制作中心，矫治器制作中心在计算机上确定托槽最佳位置后，在计算机上完成间接托槽定位托盘的制作和系列矫治弓丝的弯制并寄回给正畸医生由正畸医生完成在患者口腔内的矫治器黏着和弓丝更换。具体临床过程可分为以下五个阶段。
正畸诊疗的临床过程：
1.初诊咨询及病例诊断:
在使用上述数字化设备获得初诊患者的面像片、三维牙模型、各种X线片及病例记录后，正畸医生即可对错进行诊断，并与患者讨论治疗方案和各种方案的预后估计。由于可以在计算机屏幕上直观地看到各种方案可能的治疗结果大大促进了正畸医生与患者之间的沟通。一旦患者理解了正畸治疗对他的益处并同意接受治疗，该患者的电子病历也就同时形成了。此病历包含了常规正畸诊断所需要的一切资料，比起分散在各处的传统的实物资料更加容易检。
2.数字化治疗计划:
SureSmile矫治系统软件包含常规的头影测量分析和三维模型测量分析，模型测量主要包括牙弓长度及宽度测量、每颗牙的三维空间位置、牙量骨量协调与否的间隙分析以及针对各种治疗方案的排牙试验。在选定了具体的治疗方案以后，正畸医生可以根据自己的喜好选择某种角度的托槽，由计算机将这种虚拟的托槽粘在兰维数字化模型的准确位置上，然后再根据排牙试验获得的目标弓形选择弓丝弓形及粗细，并可根据需要增加第一、第二、第三序列弯曲，反Spee氏曲，以及各种矫治弯曲的设计。应该说数字化的治疗计划使正畸医生第一次有可能设计真正个体化的矫治器。
3.矫治器的制作:
一旦个体化的矫治器设计完毕，这些设计数据即可通过因特网传送到矫治器制作中心，中心将依据这些数据和数字模型制作间接黏着托槽的托盘，并通过由计算机控制的机器手来完成所需矫治弓丝的弯制。中心可一次提供矫治需要的所有弓丝，也可以根据治疗进程不断提供各种矫治弓丝。中心制作的间接黏着托槽的托盘和个体化矫治器在患者第二次就诊前寄达正畸医生诊所。
4.正畸治疗及疗效观测:
第二次就诊患者即可戴上个体化的固定矫治器，此时可以用微型口内扫描仪将托槽黏着位置扫人计算机与原先设计的托槽位置进行比较，以判断托位置的准确性，一旦发现错误，可以及时纠正;或者在弓丝上做细微的调整，以避免不良的治疗结果。以后的常规复诊，医生可根据需要扫描阶段牙弓变化，并随时与治疗前及目标牙弓进行对比，使正畸医生可以随时了解治疗进程、治疗效率及治疗的不良反应等，从而可以及时调整、及时纠错。
5.保持:
牙弓排列整齐后，在摘除固定矫治器之前，再次扫描牙弓形态，并将扫描结果传送到矫治器制作中心，中心会根据此数字牙弓的形态将制作好的保持器寄回医生诊所，使医生在拆除固定矫治器时，能够给患者同时戴上保持器。
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