牙颌畸形矫治过程中面颊部肌肉等软组织也相应发生变化，以取得新的平衡这种改变，利用肌电检查可发现: 如下颌向前牵引过程中主要有翼外肌活动增加。田神经肌肉机制矫治早期牙颌发育畸形，在儿童时期容易建立新的反射通路，很快能够适应。
1. 牙周膜的恢复
矫治结束后牙周组织的恢复之一是牙周膜纤维的重新排列和新牙槽骨的不断成熟。保持一个月后，牙周膜血管形态已恢复正常，透明样变区消失，骨吸收与生成活动已停止，牙动度趋于正常，但牙周纤维的重新排列与新生骨的成熟，需要更长时间。不同部位的牙周膜纤维恢复快慢不一致，主纤维较蜻上纤维容易恢复，主纤维恢复中根中部纤维最早恢复正常结构与排列 (约1个月)根尖区次之，颈部主纤维恢复最慢 (保持9个月仍不规则)。
2. 牙槽骨的改建与成熟
移动牙保持 1个月后，压力与张力侧牙槽骨表现出骨沉积线，新生牙槽骨的进一步钙化与骨小梁改建是逐步进行的，保持 9个月时新生牙槽骨仍含有较多的胶原成分，骨小梁仍呈横行排列，未形成板层骨样结构。
3. 牙周膜与牙槽骨的结合
是逐步恢复的，保持 1个月时，两者结合处的纤维交织成网，未形成典型的穿通纤维，牙槽骨表面仍不平整:保持 3个月时，牙周膜的胶原纤维已形成与牙槽骨的正常结合。
4. 牙根的吸收与修复
矫治力过大时主要是牙根的颈部和根尖区的吸收，严重时可达牙本质。正常情况下矫治力去除后牙根吸收即停止，牙骨质细胞活动增加，不断生成牙骨质，主要发生在牙根的中下部，使粗糙的根面变得光滑平整，增宽的牙周膜腔恢复正常。保持3个月时，这种修复活动基本完成，但颈部牙骨质吸收处仍不平整，其修复是较缓慢的。
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